药用寄生植物锁阳线粒体基因内含子序列分析 
苏小娟1,2 
,
刘广达1,2 ,
刘英1,2 ,
冯晓宇1,2 ,
陈贵林1,2 
,
刘广达1,2 ,
刘英1,2 ,
冯晓宇1,2 ,
陈贵林1,2
1内蒙古大学生命科学学院, 呼和浩特, 010021;
2内蒙古自治区中蒙药材规范化生产工程技术研究中心, 呼和浩特, 010021
作者 通讯作者
植物药与药理学杂志, 2012 年, 第 1卷, 第 7 篇
收稿日期: 2012年12月06日 接受日期: 2012年12月16日 发表日期: 2012年12月27日
2内蒙古自治区中蒙药材规范化生产工程技术研究中心, 呼和浩特, 010021
作者 通讯作者
植物药与药理学杂志, 2012 年, 第 1卷, 第 7 篇
收稿日期: 2012年12月06日 接受日期: 2012年12月16日 发表日期: 2012年12月27日
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本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》(2012年第34卷第2期373-381页)上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用：
引用格式(中文)：
苏小娟等, 2012, 药用寄生植物锁阳线粒体基因内含子序列分析, 基因组学与应用生物学, 34(2): 373-381 (10.13417/j.gab.034.000373)
引用格式(英文)：
Su et al., 2012, Mitochondrial Gene Intron Sequences Analysis of Medicinal Parasitic Plant Cynomorium songaricum, Genomics and Applied Biology, 34(2): 373-381 (10.13417/j.gab.034.000373)
摘 要
被子植物线粒体cox1基因的GroupI内含子常含有水平基因转移(horizontal gene transfer, HGT)现象。本研究对药用寄生植物锁阳(Cynomorium songaricum)线粒体基因cox1、cox2、nad1序列进行扩增分析，利用最大似然法对cox1和cox2基因内含子和外显子分别进行聚类分析，结果显示cox1内含子聚类结果与其他3个聚类结果不相符，说明该内含子可能存在水平基因转移现象。对比了锁阳6个不同居群间线粒体基因cox1、cox2、nad1外显子与内含子序列平均距离，发现6个不同居群间cox1基因内含子同源性高达100%，说明该基因内含子可能具有功能。结合生物信息学分析表明该内含子很有可能编码核酸内切酶，而DNA核酸内切酶被认为能促进内含子的转移。3'Co-conversion tracts(CCT)是被子植物内含子发生转移的痕迹, 对锁阳cox1基因序列进行检测发现其含有3'CCT序列且长度为35bp，RT-PCR实验验证得到cox1基因内含子可以独立转录mRNA。因此，锁阳cox1基因内含子很可能编码一个核酸内切酶，且促进了其内含子的转移。
关键词
线粒体基因； 内含子；水平基因转移；序列分析；锁阳
