甘薯淀粉合成关键酶及其基因结构与功能的研究进展  

唐维 , 李强 , 张允刚 , 王欣 , 后猛 , 马代夫
中国农科院甘薯研究所/江苏徐州甘薯研究中心, 徐州, 221121
中国农科院甘薯研究所/江苏徐州甘薯研究中心,徐州 221121
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作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9 卷, 第 65 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0065
收稿日期: 2011年03月12日    接受日期: 2011年04月28日    发表日期: 2011年05月31日
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唐维等, 2011, 甘薯淀粉合成关键酶及其基因结构与功能的研究进展, 分子植物育种 Vol.9 No.65 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0065)

摘要

本文主要介绍五种负责淀粉生物合成和加工的关键酶:ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)、颗粒结合淀粉合成酶(GBSS)、可溶性淀粉合成酶(SSS)、淀粉分支酶(SBE)、淀粉去分支酶(DBE)以及它们在甘薯中的研究进展。目前,在甘薯中仅有少量关于AGPase、GBSS、SBE的报道,而且对SSS和DBE的研究也甚少。提出应该加大对这五种淀粉合成关键酶的研究力度,从而为选育高淀粉甘薯品种提供必要的理论基础。

关键词
甘薯;ADP-葡萄糖焦磷酸化酶;颗粒结合淀粉合成酶;可溶性淀粉合成酶;淀粉分支酶;淀粉去分支酶

淀粉是一种重要食品原料和生物资源,它广泛存在于各种植物中,并且人类自身所消耗的能量50%都来源于淀粉(Martin and Smith, 1995)。除此之外,淀粉在工业中作为一种低成本、多用途、可生物降解的原料以及生物能源物质具有重要的利用价值,并且在市场上的需求与日俱增(Buleon et al., 1998; Morell and Myers, 2005)。虽然淀粉无论是作为食品原料还是工业原料都有着巨大的经济价值和重要作用,但是关于淀粉生物合成的机理我们还未完全了解。

现今,人们已经发现5种负责淀粉生物合成的关键酶类(图1):ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)、颗粒结合淀粉合成酶(GBSS)、可溶性淀粉合成酶(SSS)、淀粉分支酶(SBE)以及淀粉去分支酶(DBE)。AGPase能够催化葡萄糖-1-磷酸(G1P)和三磷酸腺苷(ATP)反应生成焦磷酸(PPi)和ADP-葡萄糖(ADPG),而ADPG是淀粉生物合成的重要底物,它直接影响着淀粉生物合成的速度和效率。据报道,在的淀粉生物合成代谢途径中,豌豆组织中的AGPase的贡献值在30%至55%之间,而且其淀粉的积累量AGPase的积累量表现出正相关(Sweetlove et al., 1999)。GBSS可以通过-1,4-D-糖苷键将ADPG中的葡萄糖残基加到引物的非还原端,能够延长葡聚糖的直链。SSS则主要是延长其支链,它是通过-1,4-D-糖苷键将ADPG中的葡萄糖残基加到侧链的非还原端,并且它的活性与支链淀粉的积累成显著正相关。SBE主要功能是首先水解直链淀粉的-1,4-D-糖苷键,接着将水解后得到的短链通过-1,6-糖苷键连接到C6末端,从而形成支链淀粉的分支结构。而DBE则是水解-1,6-糖苷键,它可以用来改变支链淀粉的结构,形成分支程度不同的支链淀粉。

 
图1 淀粉生物合成示意图(根据Toyota等(2006); 周立军等(2009)进行了修改)
注: A: 细胞中淀粉生物合成途径; B: 直链淀粉和支链淀粉的合成途径。短划线箭头表示可溶性淀粉合成酶作用位点; 长划线箭头表示淀粉分支酶作用位点。ADPG, ADP-葡萄糖; G1P, 葡萄糖-1-磷酸; G6P, 葡萄糖-6-磷酸; Glc, 葡萄糖; PPi, 焦磷酸; UDPG, UDP-葡萄糖; F6P, 果糖-6-磷酸; Fru, 果糖; NTT, 核苷酸转移蛋白; BT1, ADP-葡萄糖转运蛋白; GPT, 葡萄糖-6-磷酸转运蛋白; pGlcT, 质体葡萄糖转运蛋白; ISA, 异淀粉酶; LDA, 极限糊精
Figure 1 Schematic representation of starch biosynthesis in plants (modified from Toyota et al., 2006; Zhou et al., 2009)
Note: A: Pathway of starch biosynthesis in cell; B: Amplose and amplopectin biosynthesis, Dashed-line arrows are soluble starch synthase acting sites; Long dashed-line arrows are starch branching enzyme acting sites, ADPG, ADP-glucose; G1P, glucose 1-phosphate; G6P, glucose 6-phosphate; Glc, glucose; PPi, inorganic pyrophosphate; UDPG, UDP-glucose; F6P, fructose 6-phosphate; Fru, fructose; NTT, nucleotide transport protein; BT1, ADP-glucose translocator; GPT, glucose 6-phosphate translocator; pGlcT, plastidic glucose translocator; ISA, isoamylase; LDA, limit-dextrinase

目前,随着对淀粉合成关键酶基因研究的逐渐深入,人们对其基因序列、蛋白质结构与功能以及相关的表达调控等因子有了新的认识,尤其是在水稻、小麦、玉米中都有了突破性进展,然而关于甘薯的相关报道却不多。本文主要介绍甘薯淀粉合成酶及其基因的最新研究进展,以期为通过遗传育种对甘薯淀粉含量的提高和品种改良提供参考信息。

1甘薯ADP-葡萄糖焦磷酸华酶
1.1 AGPase的结合与功能
AGPase(EC 2.7.7.27)能催化G1P与ATP反应形成PPi和ADPG,其中ADPG是淀粉生物合成的初始底物。AGPase活性能够被甘油-3-磷酸激活,而被无基磷酸(Pi)抑制。因此,AGPase被认为是控制植物淀粉生物合成的关键调控酶。AGPase在细菌中以同源四聚体形式存在,而在高等植物中是由两个小亚基和两个大亚基构成的异源四聚体。AGPase两种亚基的氨基酸序列不同,大亚基主要起调控作用,而小亚基与底物结合,起催化作用。

1.2 AGPase的研究进展
Harn等(2000)从甘薯块根cDNA文库中分离到了3个编码AGPase大亚基的cDNA片段:iAGPLI-1iAGPLI-2iAGPLI-3,Southem杂交表明在甘薯中存在着多个拷贝的AGPase基因,其cDNAs受蔗糖的正调控表达。Kim等(2002)发现甘薯中AGPase大亚基活性在正常条件下与库强正相关。另外,在甘薯中人们又发现了2个具有非组织特异性的AGPase小亚基(Bae and Liu, 1997)。

为了进一步了解甘薯AGPase的两个小亚基的结构,Noh等(2004)克隆了2个基因(ibAGP1ibAGP2),并分析发现这两个基因编码的亚基异构体与玉米中的AGPase异构体相似。而后,Kwak等(2006)通过分析甘薯块根和胡萝卜主根中ibAGP1ibAGP2这两基因的启动子的瞬时表达情况发现甘薯内源蔗糖含量可以调节AGPase大小亚基基因的转录水平,并且这两个基因受内源蔗糖的调节作用是相反的:ibAGP1的启动子能够被蔗糖诱导,而ibAGP2的启动子却受到阻遏抑制(Kwak et al., 2006)。另外,ibAGP1ibAGP2的启动子以及其转运肽可以用来构建一个强启动子基因表达系统。尽管这两个启动子都能显著增加蛋白的表达量,然而不同的是ibAGP1的启动子和其转运肽的作用是组成型表达,没有组织特异性;ibAGP2的启动子和其转运肽则具有时间和空间上的特异性(Kwak et al., 2007; Kwak et al., 2008)。

张立明等(2005)对不同基因型甘薯块根膨大过程中淀粉积累与淀粉合成酶的关系进行了研究,发现不同基因型同一发育时期块根的APGase活性与块根淀粉含量正相关,并且前期的淀粉积累速率高于后期。陈宇星(2008)研究也发现甘薯基因型的差异是引起各淀粉合成酶活性差异的主要影响因素,并认为在生产前期不同基因型甘薯块根中的AGPase活性显著大于中后期,而且随着生产发育的进行,AGPase不断催化淀粉合成从而导致其活性也不断下降。张聪(2010)从高淀粉甘薯品种川薯34中克隆了AGPa1和AGPa2两个亚基编码序列,构建了pC-AGPa1和pC-AGPa2两个双元表达载体,并导入根癌农杆菌EHA105中,接着进行遗传转化,最终获得了5株阳性植株。

目前,AGPase是甘薯中研究最多的淀粉合成酶之一,已经从甘薯中克隆到了它的全长基因序列,对AGPase基因的表达和调控进行了相关研究,并确认AGPase作为淀粉合成的限速酶,对甘薯块根淀粉积累起着关键的作用。因此,彻底了解甘薯AGPase的结构和功能对培育高淀粉新品种有着重要的意义。

2甘薯颗粒结合淀粉合成酶
2.1 GBSS的结构与功能
GBSS(EC 2.4.1.11)是直链淀粉形成的关键酶,它能够与淀粉颗粒紧密结合,并将ADPG的葡萄糖残基转移到引物的非还原端形成α-1,4-D-糖苷键,从而最终生成线性多聚糖链分子结构。在植物的不同组织中一般存在着一种或者两种GBSS同工酶,主要包括GBSSI和GBSSII,而GBSSI又可以分为GBSSIa和GBSSIb。GBSSI以颗粒的形式附着于淀粉粒上,而GBSSII既能以颗粒形式附着于淀粉粒上,也能游离于淀粉粒外。

2.2 GBSS的研究进展
GBSS是甘薯中研究最多的淀粉生物合成酶之一,它位于质体中并负责直链淀粉的合成。甘薯GBSSI基因的全长cDNA和基因序列早已被克隆出来,而且Southern杂交实验表明甘薯中GBSSI基因有多个拷贝(Wang et al., 1999;Kimura et al., 2000)。Kimura等(2001)通过将从甘薯中克隆的GBSSI基因的正义cDNA链转入到甘薯基因组中从而获得直链淀粉缺失的转基因植株。而Noda等(2002)对6株转入GBSSI基因cDNA的转基因甘薯的淀粉进行分析,发现直链淀粉缺失型甘薯的淀粉具有特别的理化性状。Kimura和Saito(2010)又通过分析现有的甘薯GBSSI的cDNA序列,发现在它们3’末端poly(A)之前的序列具有多样性,并以此将GBSSI基因分为六大类。同时,他发现在GBSSI的3’-非编码区域有一段富含A、大小为23 bp的保守序列,并推测其poly(A)信号的近端上游因子在这段序列中。

为了研究GBSSI基因是怎样被调控的,Wang等(2001)发现GBSSI基因的mRNA和蛋白质的积累都受内部生物钟的控制,并且甘薯叶片中GBSSI基因的表达好像受到两个不同的代谢途径调控。Otani等(2007)研究发现RNA介导的基因沉默技术抑制甘薯中GBSSI基因的表达从而降低了甘薯中直链淀粉的含量。同时,人们也研究了这种转基因甘薯中淀粉的物理化学性质。Kitahara等(2007)发现抑制GBSSI基因表达会导致淀粉分子结构发生改变,直链淀粉缺失型甘薯中的淀粉表现出很缓慢的回生过程,并且可以被胰酶快速消化分解,而高直链型甘薯淀粉却恰恰相反。

如今,通过对甘薯GBSS基因结构和功能的研究,以及生物技术的利用,人们获得了直、支链淀粉比例不同的淀粉,比如直链淀粉缺失型甘薯的淀粉、高直链淀粉等。前者可以用于食品业,而后者则可用于糖果工业、塑料工业等。因此,加强对甘薯GBSS的研究对提高淀粉的应用价值有着重要的作用。

3甘薯可溶性淀粉合成酶
3.1 SSS的结构与功能
SSS(EC 2.4.1.10)主要参与支链淀粉的合成,它能够通过α-1,4-D-糖苷键将ADPG中的葡萄糖残基加到侧链的非还原端。人们已经发现植物叶片和储藏组织存在多种SSS同工酶(Kossmann and Lloyd, 2000)。至今为止,人们已经报道了4种SSS同工酶,分别是SSSI、SSSII、SSSIII和SSSIV(Ball and Morell, 2003)。

3.2 SSS的研究进展
现今,淀粉生物合成中SSSI的功能仍未完全了解,一部分原因是由于还不清楚它的结构。SSSII是豌豆胚乳中的主要淀粉合成酶,它的缺失将导致淀粉的含量和结构发生很大的变化(Craig et al., 1998)。SSSIII是马铃薯块根的主要淀粉合成酶,80%的可溶性淀粉合成酶都是SSSIII型(Abel et al., 1996; Marshall et al., 1996)。研究表明,SSSI是延长较短的支链,而SSSII和SSSIII则是分别延长中间长度和较长的支链(Ball and Morell, 2003)。SSSIV是最近在拟南芥中发现的,其功能可能是参与淀粉颗粒形成的起始阶段,生成较短的葡聚糖链(Roldan et al., 2007)。尽管在很多植物中都对SSS进行了研究,然而在甘薯中却罕有相关报道。因此,开展甘薯SSS的相关研究对培育甘薯新品种具有重要意义。

4甘薯淀粉分支酶
4.1 SBE的结构与功能
SBE(EC 2.4.1.18)是α-1,4-D-葡萄糖-α-6-[α-1,4-葡萄糖]-转移酶,水解直链淀粉的α-1,4-D-糖苷键,将切下的短链转移到相似或者不同的葡聚糖链上形成α-1,6-糖苷键,从而生成支链淀粉(Pan and Nelson, 1984;Hussain et al., 2003)。根据高等植物中SBE的氨基酸序列,SBE主要分为A型(马铃薯SBEIIa、玉米SBEIIa和豌豆SBEIa等)和B型(马铃薯SBEIb、玉米SBEb和豌豆SBEIIb等)。

4.2 SBE的研究进展
Jobling等(1999)研究发现SBE对淀粉颗粒的分子结构,尤其是支链淀粉的链长有重要影响。Kim等(2005)成功克隆了甘薯的SBE基因(Iblsal),并发现其转录水平在块根完全形成后开始增加。这表明Iblsal基因在淀粉合成过程中发挥了作用。Hamada等(2006)也从甘薯中克隆了一个SBEI基因(IbSBE),并对IbSBE的时空表达进行了研究,发现在甘薯这种六倍体植物中存在多少拷贝,而且在淀粉生物合成的各个组织中都有表达。同时,Shimada等(2006)将含有编码甘薯SBEII基因(IBSBEII)的双链RNA(dsRNA)载体导入甘薯基因组中,使得内源的IBSBEII基因被沉默,从而导致淀粉中直链淀粉的含量显著增加;另外,IBSBEII基因在甘薯中有多个拷贝,并且也在淀粉生物合成的各个组织中都有表达。Pao等(2005)对SBE基因转录的日变化水平进行了研究,发现其日变化可被自身的生物钟所控制,还发现在SBE基因启动子序列中存在若干个与昼夜和光照有关的调控因子。

SBE是决定支链淀粉结构的关键酶,也是调节直、支链淀粉比例的重要淀粉合成酶,与GBSS相比,它主要是修饰支链淀粉的分子结构从而改变淀粉粒的形态。因此,继续加强对甘薯SBE基因表达调控的研究从而获得不同结构的淀粉颗粒,对改良淀粉品质以及满足人们的不同需求有着重要的作用。

5甘薯淀粉去分支酶
5.1 DBE的结构与功能
DBE作为一种α-1,6-葡聚糖水解酶能够催化多糖链中的α-1,6-糖苷键水解,并且是决定支链淀粉结构的重要因素之一。改变DBE的活性就可以改变直链淀粉和支链淀粉之间的比例以及支链淀粉的结构,从而形成分支程度不一的支链淀粉,并使淀粉具有新的理化特性。迄今为止,根据DBE的氨基酸序列不同和作用的底物差异,人们将其划分为两大类:异淀粉酶(Isoamylase, ISA; EC: 3.2.1.68)和极限糊精酶(limit-dextrinase, LDA; EC: 3.2.1.142)。ISA含有3种同工酶,分别是ISA1、ISA2和ISA3,而ISA1和ISA2主要参与支链淀粉合成的反应中(Hussain et al., 2003)。

5.2 DBE的研究进展
在马铃薯块根和拟南芥叶片中,ISA1与ISA2组合在一起,形成一个异源多聚体复合酶。其中ISA1活性最高,它作用于较长的外部支链(比如可溶性淀粉),ISA2则可能起调节作用在反应过程中没有催化活性,而ISA3和LDA的主要作用是淀粉的降解,并对较短的外部支链有很高活性(比如β-极限糊精)(Delatte et al., 2005; Wattebled et al., 2005)。James等(1995)曾报道在玉米su1(su1在水稻、玉米和小麦中编码ISA)突变体中,胚乳中支链淀粉的积累显著降低。Burton等(2002)也报道在大麦中,ISA-1基因突变导致胚乳中支链淀粉生物合成受到限制。人们还发现在导入ISA反义cDNA的转基因植株胚乳中,ISA的含量明显下降,只有原来的6%,而疏水性支链淀粉和水溶性聚葡萄糖含量却显著增加(Fujita et al., 2003)。虽然关于DBE的研究有了不少的进展,但是在甘薯中却还未查到相关报道。因此,开展甘薯DBE基因的研究工作,了解DBE同工酶在甘薯中的各自作用对我们提高甘薯淀粉品质和改善食用口味有着重要的作用。

6小结
6.1 近年来淀粉合成酶的研究成果
近年来,人们对淀粉合成酶的研究已经取得了很大的进展,尤其是克隆了不同作物中的淀粉合成酶的相关基因,并对关键基因的种类和功能及其表达调控研究都进行了较为深入的分析,大大提高了人们对淀粉生物合成分子机理的认识。同时,人们利用转基因技术获得了淀粉合成酶基因超量表达的转基因植株,显著增加了淀粉的含量;并通过基因缺失、突变、沉默等生物技术改变酶活性,使淀粉结构和功能都发生了改变,获得了各种理化性状的淀粉。

6.2 甘薯淀粉合成酶研究亟待解决的问题
虽然前人对淀粉合成酶的结构和功能进行了大量的研究,但在甘薯领域其相关研究起步较晚,还需要一段时间去研究淀粉合成酶在甘薯中的具体结构和作用。现在我们仅停留在对甘薯AGPase、GBSS和SBE这3种淀粉合成酶的初步了解中,对甘薯SSS和DBE的研究甚少。另外,对甘薯AGPase的大小亚基之间的互作关系、GBSS和SBE中同工酶之间的相互作用,以及它们在淀粉生物合成代谢途径中的调控机制还未完全了解,尤其是对基因转录和翻译的相关研究较少。同时,甘薯作为异源六倍体植物,其基因组结构较为复杂,每个淀粉合成酶基因应该都存在着多个拷贝,但每个拷贝基因是否都有表达,对淀粉生物合成的贡献作用是否相同都还不清楚。除此之外,在不同的环境条件和栽培措施下相同基因型甘薯品种淀粉合成酶基因的表达差异以及在相同条件下不同基因型甘薯品种淀粉合成酶基因表达差异的研究也较少,现阶段主要对甘薯淀粉合成关键酶中的AGPase基因有了初步研究,发现甘薯基因型的差异是引起AGPase差异的主要影响因素。

除了这五种酶外,在淀粉生物合成代谢途径中是否有其他的酶共同参与生化反应,比如淀粉酶、异化酶、磷酸化酶等,目前还未得到明确结论(谭彩霞等, 2008)。而Tanaka等(2009)曾报道将甘薯SRF1基因转入受体甘薯植株中并使其过量表达,发现相同鲜重块根中转基因甘薯的淀粉含量高于野生型甘薯,说明SRF1基因参与了淀粉合成代谢途径调控。

6.3 甘薯淀粉合成酶研究的意义
综上所述,既要继续加强甘薯淀粉合成酶基因的相关研究,又要将此分子生物学研究与甘薯新品种创新和品质改良结合起来,将理论研究更好的与生产实践挂钩。这样才能培育出农艺综合性状良好、抗病性强的高淀粉新品种,才能更好的服务于甘薯产业的发展,对缓解21世纪即将面临的能源危机具有重要的作用。

作者贡献
唐维和李强是本综述的设计和研究的执行人;唐维完成资料分析,论文初稿的写作;张允刚、王欣和后猛参与本综述的校对工作;李强和马代夫是项目的构思者及负责人,指导论文写作与修改。全体作者都阅读并同意最终的文本。

致谢
本研究由国家科技支撑计划(2009BADA7B03)、国家高技术研究发展计划 (2009AA10Z102)、国家农业产业技术体系(CARS-11)以及江苏省“六大人才高峰”(2008201)共同资助。感谢两位匿名的同行评审人的评审建议和修改建议。

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《分子植物育种》网络版
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