水稻AGPase小亚基基因的克隆测序及种质间遗传分化的研究  

赵颖 , 朱高倩 , 孙朝华 , 金寿林 , 谭学林
云南农业大学稻作研究所, 昆明, 650201
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2012 年, 第 10卷, 第 58 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0058
收稿日期: 2012年05月02日    接受日期: 2012年05月07日    发表日期: 2012年12月15日
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本文首次发表在 《分子植物育种》(2012年第10卷第5期559-567页)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):
赵颖等, 2012, 水稻AGPase小亚基基因的克隆测序及种质间遗传分化的研究, 分子植物育种(online) Vol.10 No.58 pp.1422-1430 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0058)
引用格式(英文):
Zhao et al., 2012, Cloning and Sequencing of Rice ADP-Glucose Pyrophosphorylase Small Subunit Gene and Study on Genetic Transformation among Germplasm, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.58 pp.1422-1430 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0058)
 

摘 要

淀粉是构成和影响水稻产量和品质的最主要因素;ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)基因是影响淀粉合成的关键酶基因之一。本研究用编码AGPase小亚基基因(AGPsma)序列的特异引物(序列为F: 5'-TACGCTATGCTCTTGAAAC-3'; R: 5'-TATCTTCCCAGTAACCATCA-3')对普通野生稻(元江)、粳稻(榆密15)、籼稻(93-11)及籼粳交品系(南34)进行PCR扩增、克隆、测序和序列对比。又用该引物对来源于13个国家的15份AA基因组和5份CCDD基因组的共20份野生稻及205份包括40份籼稻和165份粳稻的云南地方品种和改良品种(系)进行PCR检测。在以上4个不同类型水稻材料该引物上扩增出184 bp和215 bp的2个片段均为AGPase小亚基基因的序列。在该序列的109 bp处,元江普通野生稻和榆密15为T,而93-11和南34为C;籼粳交品系南34在121~151 bp区间缺失31个碱基。所有的225份供试材料可分为3类。第一类具有215 bp大小的条带,包括了全部的野生稻材料和196份籼粳材料。其中籼稻数占籼稻样本总数的95%,籼稻地方品种占籼稻地方品种总数的75%;粳稻数占粳稻样本总数的83.6%,粳稻地方品种占粳稻地方品种总数的60%。第二类具有184 bp的条带,包括28个籼粳材料。第三类同时具有215 bp和184 bp的片段,此类只有1个父母本具不同片段的滇型杂交粳稻品种。结果表明AGPsma序列在野生稻中可能尚未出现分化,但在籼稻、粳稻和地方老品种及改良品种中都出现了遗传分化。

关键词
ADP-葡萄糖焦磷酸化酶; AGPsma; 栽培稻; 野生稻; 遗传分化
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