研究报告/Research Report

基于重测序的烟草赤星病抗性关联SNP位点挖掘  

王文静1 , 王凤龙1 , 焦芳婵2 , 孙光军3 , 宋光龙3 , 陈风雷3 , 王卫民4 , 吴晶晶4 , 王晓强1
1中国农业科学院烟草研究所, 青岛, 266101;
2云南省烟草农业科学研究院, 昆明, 650021;
3中国烟草总公司贵州省公司, 贵阳, 550004;
4浙江中烟工业有限责任公司, 杭州, 310000
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2021 年, 第 19卷, 第 16 篇   
收稿日期: 2021年04月06日    接受日期: 2021年04月06日    发表日期: 2021年04月13日
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本文首次发表在 《分子植物育种》(ISSN1672-416X,CN46-1068/S)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:
王文静, 王凤龙, 焦芳婵, 孙光军, 宋光龙, 陈风雷, 王卫民, 吴晶晶, 王晓强, 2021, 基于重测序的烟草赤星病抗性关联SNP位点分析, 分子植物育种(网络版), 19(16): 1-6 (doi: 10.5376/mpb.cn.2021.19.0016) (Wang W.J., Wang F.L., Jiao F.C., Sun G.J., Song G.L., Chen F.L., Wang W.M., Wu J.J., and Wang X.Q., 2021, Identification of SNPs associated with tobacco brown-spot resistance based on re-sequencing, Fengzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding (online)), 19(16): 1-6 (doi: 10.5376/mpb.cn.2021.19.0016))
摘 要

赤星病是烟草上的重要叶部病害,每年给烟草生产造成巨大损失,培育抗赤星病品种是防治烟草赤星病为害的根本措施,而对赤星病抗性关联遗传位点的发掘、鉴定和利用是培育抗赤星病烟草品种的关键基础。本研究利用抗赤星病的烟草材料Beinhart 1000-1和加工品质好但不抗赤星病的烟草品种K326,通过种间杂交和F1代自交分离,创建了Beinhart 1000-1和K326的F2代杂交分离群体。随后,通过赤星病抗病性鉴定,在F2代分离群体中选择了19株抗赤星病材料和19株感赤星病材料,分别进行了基因组DNA提取,并通过BSA法进行了基因组重测序。在重测序数据分析基础上结合表型鉴定结果,鉴定出差异SNP位点约170万个,进行了烟草赤星病抗性关联SNP位点分析,找到赤星病抗性相关基因10个,促进了烟草抗赤星病分子育种的发展。

关键词
烟草赤星病;重测序;SNP
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《分子植物育种》网络版
• 第 19 卷
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