苹果茎痘病毒梨分离物外壳蛋白基因的克隆与分子变异分析  

刘娜 , 牛建新
石河子大学农学院园艺系, 石河子, 832003
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 92 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0092
收稿日期: 2011年06月17日    接受日期: 2011年07月05日    发表日期: 2011年07月12日
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引用格式(中文):
刘娜等, 2011, 苹果茎痘病毒梨分离物外壳蛋白基因的克隆与分子变异分析, 分子植物育种(online) Vol.9 No.92 pp.1653-1661 (doi: 10.5376/mpb. cn.2011.09.0092)
引用格式(英文):
Liu et al., 2011, Cloning and Sequencing and Molecular Variability of Apple stem pitting virus CP Gene from Pear, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.9 No.92 pp. 1653-1661 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0092)

摘 要

本研究利用RT-PCR技术扩增了来自新疆地区的库尔勒香梨、鸭梨的苹果茎痘病毒外壳蛋白基因,克隆测序结果表明,ASVP CP基因全长1 194 bp,编码397个氨基酸,分子量约42 KDa。与GenBank上公布的25个ASVP CP基因编码的氨基酸序列的同源率为70%左右。多重氨基酸序列比对结果显示,aa1-177之间变异较大,为高变区,而后130个氨基酸高度保守。对CP基因位点扫描发现,CP基因的活性和识别位点主要分布在高度保守区域,位点包括:Cys位于aa292,ProProXXTrp位于aa309-313,AryXPheAspPhe位于aa325-329及Pro位于aa349。系统进化分析结果表明,来自世界各地的ASPV分离物可分为3大类群,分别为:第一类群是以苹果为寄主的类群,第二类群是以梨为寄主的类群,第三类群是以新疆栽培的梨品种为寄主的类群。呈现一定的寄主相关性。

关键词
苹果茎痘病毒;库尔勒香梨;外壳蛋白基因;序列分析
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