王晶 , 张春宵 , 王凤华 , 郝彩环 , 杨德光 , 李晓辉

1东北农业大学农学院, 哈尔滨, 150030
2吉林省农业科学院生物技术研究中心, 长春, 130033
3吉林省农业科学院/农业部植物新品种测试公主岭分中心, 公主岭, 136100
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2012 年, 第 10卷, 第 7 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0007
收稿日期: 2012年02月10日    接受日期: 2012年02月27日    发表日期: 2012年03月07日

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推荐引用：

引用格式(中文)：
王晶等, 2012, 适于高梁DNA指纹图谱库构建的核心SSR引物的确立, 分子植物育种(online) Vol.10 No.7 pp.1049-1060 (doi: 10.5376/mpb. cn.2012.10.0007)
引用格式(英文)：
Wang J., et al., 2012, Determining SSR Core Primers for Establishing DNA Fingerprinting Profiles in Sorghum, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.7 pp.1049-1060 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0007)

本研究以119份高梁种质为试材，对搜集并合成的288对高梁SSR引物经过初筛、复筛和终筛，最终确立均匀分布于高粱10个连锁群上的，扩增带型清晰、稳定且多态性水平高的41对引物作为构建高梁DNA指纹图谱数据库的核心引物。这批引物既适用于变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，又适用于高通量的DNA测序仪检测。共检测出的总等位变异数为193，每对引物检测出2~9个等位基因，平均4.7个；有效等位变异数在1.157 2~5.469 0之间，平均2.814 6；Shannon-Weaver指数在0.262 0~1.881 3之间，平均1.116 4；基因流在0.322 8~4.034 3之间，平均1.034 4；Nei期望杂合度在0.135 8~0.817 2之间，平均0.581 6；多态性信息量在0.135 9~0.817 1之间，平均0.581 6。这批引物用于高粱DNA指纹图谱库构建是完全可行的。本研究结果对于在分子水平上开展高梁品种鉴定、品种审定和品种权保护具有重要意义。

高梁；SSR；指纹图谱；核心引物