云南省134个水稻新品种DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析  

吴毅歆1* , 刘春明2* , 毛自朝1 , 李学进3 , 何月秋1,2
1. 云南农业大学农业与生物技术学院, 昆明, 650201 2. 云南农业大学农业生物多样性应用...
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2012 年, 第 10卷, 第 39 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0039
收稿日期: 2012年06月25日    接受日期: 2012年07月06日    发表日期: 2012年08月07日
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引用格式(中文):
吴毅歆等, 2012, 云南省134个水稻新品种DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析, 分子植物育种(online) Vol.10 No.39 pp.1287-1296 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0039)
引用格式(英文):
Wu et al., 2012, Establishment of DNA Fingerprinting Profile and Genetic Analysis for 134 New Released Rice Varieties in Yunnn Province, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.39 pp.1287-1296 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0039)

摘 要

利用SSR标记研究134个云南省水稻新品种的种子纯度、遗传多样性,并构建DNA指纹图谱。结果表明,95.52%品种纯度达90%以上,4.48%品种纯度低于90%。12对引物共检测出55个等位基因,平均每个标记4.583 3个,变幅2~7个;平均有效等位基因总数为4.257 5个,变幅1.342 0~3.771 9个,Shannon多样性指数(I)平均值1.133 6,变化幅度0.5378~1.5022;多态性信息含量(PIC)平均值为0.605 5,变动范围0.254 8~0.734 9。134个品种之间的遗传相似性系数变异范围为0.222 2~0.975 6,平均遗传相似性系数为0.592 9,其中遗传相似性系数大于0.500 0的品种对占供试品种对的77.06%,表明大部分供试品种之间的亲缘关系较近,遗传基础狭窄。UPGMA聚类分析果表明,在遗传相似系数为0.560 4处,134个供试品种划分为8个类群,类群I包括115个品种,占所有测试品种总数的85.82%,表明供试品种的遗传背景比较单一。

关键词
水稻;简单重复序列;DNA指纹;遗传分析
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《分子植物育种》网络版
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