研究报告

黑果枸杞中调控花青素合成代谢的bHLH 基因克隆与序列分析  

赵鑫1 , 李建民1 , 朱雪冰1 , 郑旭莹3 , 宗渊3 , 刘宝龙2*
1青海师范大学生地学院,西宁, 810008; 2 青海省作物分子育种重点实验室,西宁, 810001; 3青海大学,西宁, 810016
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2017年09月21日    接受日期: 2017年10月20日    发表日期: 2019年01月17日
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摘要

以黑果枸杞为研究对象,利用 RT-PCR 方法从黑果枸杞 cDNA中克隆一个 bHLH 的转录因子—— —LrJAF13,通过生物信息学的分析,发现该基因的全长为 1 890 bp,编码 624 个氨基酸的亲水蛋白,其分子式 是 C3012H4843N853O978S24,分子量为 6.94 kD,脂肪指数(Aliphatic index)为 85.45,等电点 pI为 5.24,亲水性(Grandaverage of hydropathicity)为 -0.497,不稳定指数(Instability index)为 50.13,推断出该基因编码的蛋白位于细胞核中,蛋白质三维结构复杂,包含多个 琢- 螺旋和 茁- 折叠结构,与矮牵牛拟南芥 bHLH 基因编码的蛋白序列的一致性为 88%,进化树的分析表明黑果枸杞的 LrJAF13 与矮牵牛的 bHLH 的转录因子 petunia_JAF13的亲缘关系比较接近。通过上述分析,为解析黑果枸杞果实中高花青素含量的分子遗传机理、优异资源筛选和新品种选育提供了理论依据。

关键词
黑果枸杞; bHLH;基因克隆;序列分析

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《分子植物育种》印刷版
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