研究报告/Research Report

蓖麻 RcFAH12 基因 cDNA 全长克隆及生物信息学分析  

狄建军1,2,4,5,6,7* , 张庆波1 , 王月3 , 佘集凯1 , 张树军1,4,5,6 , 黄凤兰1,4,5,6 , 李国瑞1,4,5,6 , 陈永胜1,4,5,6 , 陈宇杰1,4,5,6,7
1 内蒙古民族大学生命科学学院, 通辽, 028043; 2 沈阳农业大学农学院, 沈阳, 110866; 3 内蒙古民族大学农学院, 通辽, 028043; 4 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心, 通辽, 028043; 5 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室, 通辽, 028043; 6 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心, 通辽, 028043; 7 内蒙古民族大学生物信息学重点实验室, 通辽, 028043
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2017年12月05日    接受日期: 2019年01月05日    发表日期: 2018年08月07日
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推荐引用:

引用格式:Di J.J., Zhang Q.B., Wang Y., She J.K., Zhang S.J., Huang F.L., Li G.R., Chen Y.S., and Chen Y.J., 2018, Full-lengthcDNA cloning and bioinformatics analysis of RcFAH12 gene in castor, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(14):4583-4591 (狄建军, 张庆波, 王月, 佘集凯, 张树军, 黄凤兰, 李国瑞, 陈永胜, 陈宇杰, 2018, 蓖麻 RcFAH12 基因 cDNA 全长克隆及生物信息学分析, 分子植物育种, 16(14): 4583-4591)

摘要

RACE 技术是一项扩增基因末端序列的新技术。本研究以蓖麻籽的 RNA 为模板,以 GenBank FAH12 基因序列设计特异引物,运用 RT-PCR RACE 技术扩增并获得了特异片段。该片段经 PCR、酶切和测序验证,证实所克隆序列为蓖麻 FAH12 cDNA 全长序列。生物信息学分析,此片段包含 1 164 bp 组成的开放读码框(ORF),编码 387 个氨基酸,分子量为 44 426.21 DapI=8.95。同源性分析结果表明,它与麻疯树、陆地棉、百脉根和杏的 FAH12 基因的同源性均高于 70%。构建了系统进化树,蓖麻和麻风树、橡胶、木薯聚类到一起,这与生物学分类相同,都为大戟科植物。成功克隆蓖麻 FAH12 基因 cDNA 全长,这为后续进一步的分子生物学研究提供了帮助。

关键词
蓖麻;FAH12 基因;RT-PCR;RACE;克隆

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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