研究报告/Research Report

牡丹长链脂酰辅酶A合成酶基因PsLACS的克隆及生物信息学分析  

刘春英1,2 , 李方正3 , 张玉喜2 , 卢向阳1
1湖南农业大学生物科学技术学院, 湖南省农业生物工程研究所, 长沙, 410128;
2青岛农业大学生命科学学院, 山东省高校植物生物技术重点实验室, 青岛, 266109;
3青岛农业大学动物科学学院, 青岛, 266109
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 21 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001343
收稿日期: 2014年12月02日    接受日期: 2015年01月20日    发表日期: 2015年06月02日
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推荐引用:

Liu C.Y., Li F.Z., Zhang Y.X., and Lu X.Y., 2015, Molecular cloning and bioinformatics analysis of PsLACS gene from tree peony (Paeonia suffruticosa), Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(6): 1343-1348 (刘春英,李方正,张玉喜,卢向阳,2015,牡丹长链脂酰辅酶A合成酶基因PsLACS的克隆及生物信息学分析,分子植物育种,13(6): 1343-1348)

摘要

根据本实验室前期获得的长链脂酰辅酶A基因的EST序列设计引物,本研究利用RACE扩增从牡丹中得到2 377 bp的PsLACS全长cDNA,其中,包括5'UTR 347 bp,3'UTR 200 bp和1 830 bp的编码区,共编码609个氨基酸,分子量为67.94 kD。PsLACS包括30个可能的磷酸化位点,其中14个位于丝氨酸(S),7个位于苏氨酸(T),9个位于酪氨酸(Y),这可能与酶活性的调节有关。二级结构预测显示,PsLACS含α-螺旋和无规则卷曲较多。同源性分析结果表明,PsLACS与葡萄LACS同源性最高,其次是橙子LACS、蓖麻LACS。系统进化树分析结果与同源性比对的结果基本一致。研究结果可为进一步研究牡丹PsLACS基因的功能提供了理论基础。

关键词
牡丹(Paeonia suffruticosa Andr.);PsLACS;RACE扩增;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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