研究报告/Research Report

沙柳SpsLAS基因克隆及生物信息学分析  

路东晔 , 贺玉娇 , 金娜 , 刘乐 , 卜松雪 , 王雷 , 杨海峰
内蒙古农业大学林学院, 呼和浩特, 010019
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2017 年, 第 15 卷, 第 52 篇   
收稿日期: 2016年07月18日    接受日期: 2016年08月01日    发表日期: 2016年08月02日
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摘要

LAS基因对于植物侧生分生组织有重要影响。它被证实在拟南芥、番茄等草本科植物营养生长阶段参与腋生分生组织的形成,但在木本植物中的基因功能尚缺乏深入研究。本研究以沙柳为材料,利用RT-PCR技术成功克隆沙柳LAS基因,命名为SpsLAS,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该基因CDS序列全长1 320 bp,编码439个氨基酸,预测蛋白分子量为49.8768 Da,理论等电点(PI)为6.66,是亲水性蛋白;同源氨基酸序列比对结果表明沙柳LAS基因与番茄LS、拟南芥LAS等功能已确认的LS亚家族基因同源性较高,氨基酸相似性达50%以上;系统进化分析表明SpsLAS与杞柳和毛果杨亲缘关系更近;对LAS进行功能结构域分析得知LAS基因具有GRAS基因家族典型特征,属于GRAS基因家族LS亚家族;预测未发现跨膜结构和信号肽区域;SpsLAS蛋白二级结构包含173个α螺旋(Alpha helix),72个延伸链(Extended strand),194个无规则卷曲结构(Random coil);亚细胞定位预测该基因很可能定位于细胞核内。沙柳LAS基因的克隆对于研究木本植物萌蘖及其分枝机制有重要意义,同时丰富了木本植物中GRAS基因家族的相关研究。

关键词
沙柳;LAS;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 15 卷
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