研究报告/ Research Report

水稻DUF966基因家族的生物信息学分析  

罗成科 , 田蕾
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2017 年, 第 15卷, 第 38 篇   
收稿日期: 2017年05月22日    接受日期: 2017年05月31日    发表日期: 2017年08月31日
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摘 要

DUF966基因家族是一类未知功能的基因家族,它们在水稻生长发育和逆境胁迫应答反应中可能起重要作用,为了研究这些基因的生物学功能,初步揭示它们对水稻生长发育和抗逆性的调控作用,本研究通过生物信息学方法,分析了水稻DUF966家族基因特征、系统进化、芯片表达谱、跨膜结构域、信号肽以及亚细胞定位。结果表明,水稻DUF966基因家族包含7个成员,几乎都具有转录活性,它们编码的蛋白质只包含1~2个保守的未知功能结构域(DUF966结构域);进化分析表明,该家族可分为4个亚群,其中OsDSR2、OsDSR4、OsDSR5和OsDSR6同属一个亚群,可能具有相似的生物学功能;芯片表达谱分析表明,该家族基因主要在幼苗、花序和茎中呈中、低度表达,OsDSR3OsDSR7基因受盐和低温胁迫的诱导表达,其它基因受不同非生物胁迫的抑制表达,该家族多数基因还能被白叶枯病菌侵染诱导表达;蛋白预测表明,该家族蛋白不含跨膜结构域和信号肽序列,能够被定位在细胞质中。本研究为系统开展水稻DUF966基因家族的生物学功能研究提供了依据。

关键词
水稻;未知功能结构域(DUF);DUF966基因家族;生物信息学
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• 第 15 卷
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