研究报告/Research Report

基于SSR标记的花菜类种质亲缘关系和群体遗传结构分析  

刘春晴 , 李光庆 , 姚雪琴 , 蔡杰 , 谢祝捷
上海市农业科学院园艺研究所, 国家蔬菜改良上海分中心, 上海市设施园艺技术重点实验室, 上海, 201106
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 18 篇   
收稿日期: 2017年06月15日    接受日期: 2017年07月10日    发表日期: 2017年08月02日
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摘 要

利用SSR标记选用41对带型清晰的多态性引物145个花菜类品种和资源材料进行遗传多样性分析。共检测到274个多态性位点每组合的多态性条带数从3~17之间,平均为7.0。利用NTSYS-pc 2.10e软件采用Jaccard’s相似系数和UPGMA方法进行聚类分析。结果表明,通过群体遗传结构分析将供试材料分为4亚群。大部分具有亲缘关系的品种依青花菜、松花菜、紧花菜、芥蓝各聚为一类群,其结果与花菜形态学分类具有高度的相符性145个品种的平均遗传相似系数为0.77变化范围在0.59~0.99之间,青花菜、紧花菜、芥蓝品种间的平均相似系数均为0.81,松花菜为0.88,类群内品种间的遗传多样性较低。以GLM分析,发现28个与熟性相关联的标记,各标记对表型变异的解释率在0.0418-0.2108;以MLM分析,发现8个与熟性相关的标记,各标记对表型变异的解释率在0.0415-0.0732。这些标记主要位于C2C5C9染色体。

关键词
花菜;SSR;遗传多样性;聚类分析;群体结构;关联分析
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• 第 16 卷
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