研究报告Research Report

小麦Wcor15基因上游调控区克隆及生物信息学分析  

刘方方 , 殷桂香 , 佘茂云
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2017 年, 第 15卷, 第 44 篇   
收稿日期: 2017年06月23日    接受日期: 2017年07月18日    发表日期: 2017年09月04日
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摘 要

为了克隆小麦Wcor15基因启动子序列和预测可能的表达调控途径,试验设计特异引物采用PCR方法从小麦基因组DNA中直接进行扩增并测序,用Neural Network Promoter Prediction、Promoter SCAN、Promoter 2.0和MethPrimer软件对启动子结构进行分析,PLACE在线分析预测可能的顺式作用元件。结果表明:克隆获得了一段长度为2046 bp的Wcor15基因上游调控区序列,软件预测显示该区域含有4个可能的启动子,除了具有一般启动子的CAAT-box、TATA-box典型结构外,还含有CBFHV、ACGTATERD1、ABRELATERD1、ARR1AT、CANBNNAPA应答非生物胁迫、激素等重要作用元件。序列比对发现小麦Wcor15启动子与拟南芥cor15a、大麦cor14b的一致性分别为36.92%和40.29%。

关键词
小麦;Wcor15基因;启动子;克隆;生物信息学
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