研究报告/Research Report

三角梅SOD基因家族成员的克隆与生物信息学分析  

郭怀攀 , 赵金星 , 邱志浩 , 佘文琴
福建农林大学园艺学院, 福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2017年06月29日    接受日期: 2017年08月17日    发表日期: 2018年05月22日
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摘 要

SOD基因家族在植物对抗活性氧破坏细胞膜透性及保护细胞膜完整性中有着重要作用。本研究以伊丽莎白•安格斯(Bougainvillea glabra ‘Elizabeth Angus’)为模板,得到了Fe-SOD基因保守序列片段及Cu/Zn-SOD和Mn-SOD基因全长序列,其中,胞质型CSD共2种编码类型:cyCSD1型和cyCSD2型,其分子式分别为C920H1507N265O298S17和C863H1415N249O272S15,开放阅读框(ORF)全长分别为585 bp和543 bp,编码氨基酸长度分别为194个和180个,蛋白相对分子量分别为21.59 KD和20.11 KD,理论等电点(PI)分别为8.12和9.16,皆属不稳定的碱性疏水蛋白;Mn-SOD具有711 bp ORF,编码236个氨基酸,相对分子量为26.33 KD,分子式为C1191H1849N321O340S7,PI为7.84,属稳定的偏碱性疏水蛋白。膜结构预测结果表明,cyCSD 1型蛋白可能与cyCSD 2型蛋白皆可能存在2个跨膜螺旋,长度分别为17和19个氨基酸,17和21个氨基酸;MSD蛋白没有发现跨膜结构域,可能不存在跨膜螺旋。亚细胞定位结果表明,cyCSD蛋白推定定位在细胞质膜;MSD蛋白定位于线粒体质膜。研究推测,所得基因序列为三角梅SOD基因家族成员。

关键词
三角梅;SOD;RT-PCR;克隆;生物信息学分析
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• 第 16 卷
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