研究报告

枸杞 LbXEGIP1 基因的克隆与生物信息学分析  

管翠萍 , 王俊文 , 王丽娟 , 郑蕊 , 石晶*
宁夏大学, 生命科学学院, 银川, 750021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2018年01月26日    接受日期: 2018年03月06日    发表日期: 2019年01月11日
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摘 要

内切葡聚糖酶抑制蛋白(XEGIP)在植物防御病原菌侵袭中扮演了重要角色。本研究以宁夏枸杞(Lycium barbarum L.) ‘宁杞 1 号’为试验材料,采用 RACE 技术从枸杞花药 cDNA 中成功克隆了枸杞的XEGIP1基因,命名为 LbXEGIP1GenBank 登录号为 MG744343。结合生物信息学方法对 LbXEGIP1 基因编码的蛋白质进行理化性质、信号肽、亚细胞定位、蛋白结构以及系统进化等方面的预测分析。结果表明,该基因 CDS 序列全长 1 290 bp,编码 429 个氨基酸,预测蛋白分子量为 47.39 kD,等电点为 8.59,是一个含有一个跨膜区和信号肽区域,脂溶性的稳定蛋白,它的亚细胞定位于细胞分泌途径中。LbXEGIP1 属于天冬氨酸蛋白酶 A1 亚家族,在其 N 端和 C 端分别具有葡聚糖酶抑制子结构域。在其二级结构中无规则卷曲所占比例最高(35.66%),其次是延伸链(30.77%)。系统进化分析表明 LbXEGIP1 蛋白与甜椒中的 XEGIP 亲缘关系最近。枸杞 XEGIP1 基因的克隆及生物信息学分析,为后续研究该基因的功能以及枸杞病虫害的防治方面提供了依据。

关键词
枸杞;XEGIP1;基因克隆;生物信息学分析
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