研究报告

基于转录组测序的云南‘火把梨’花青素相关基因分析  

王大玮1,2,3* , 沈兵琪1,2,3 , 周凡1,2,3 , 周军4
1 西南林业大学, 云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室, 昆明, 650224; 2 西南林业大学, 西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室, 昆明, 650224; 3 西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室, 昆明, 650224; 4 北方民族大学生物科学与工程学院, 银川, 750021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2018年05月09日    接受日期: 2019年05月26日    发表日期: 2019年05月15日
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摘 要

本研究以云南‘火把梨’转色前后的梨果皮为试验材料,采用高通量测序技术(Illumina HiSeqTM 2000/MiSeq)对两种梨材料全转录功能基因组测序后组装,再通过 GOSwiss-Prot 两大数据库进行花青素相关差异表达基因筛选,以了解可能与花青素合成相关的基因及其表达模式,同时将差异基因在 NCBI 数据库进行Blast 序列比对,对其功能进行分析。最终共获得 7.52 Gb 数据,组装过滤后共获得 75 227 538 Clean reads3 920 条差异表达基因,通过通路分析和 Pathway 功能注释,在花青素合成过程中的两条通路中共注释到 30条与花青素合成相关的差异表达基因,初步对这些差异基因的功能进行鉴定和分析,对后期基因克隆及转基因等研究具有重要意义。

关键词
梨;花青素;转录组;功能注释
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• 第 17 卷
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