研究报告

基于转录组金银花WRKY转录因子的挖掘与分析  

陈亮 , 崔芬芬 , 王勇飞 , 曹亚萍 , 宋芸 , 乔永刚*
山西农业大学生命科学学院, 太谷, 030801
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2018年05月10日    接受日期: 2018年05月30日    发表日期: 2019年05月15日
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摘 要

WRKY 转录因子是植物抗逆应答过程中最为常见的蛋白家族。为了挖掘金银花抗寒相关的 WRKY基因,本研究基于已有的转录组数据,利用植物转录因子数据库和 BioEdit WRKY 进行筛选及保守结构域分析,对筛选出的 WRKY 转录因子利用 ExPASy 进行理化性质分析,利用 PSORT 进行亚细胞定位预测,NetPhos 进行磷酸化位点分析并且利用 MEME 数据库对 WRKY 基因的氨基酸进行序列分析,运用 MEGA 软件对筛选的金银花 WRKY 转录因子基因和 21 个已知抗寒的 WRKY 基因进行序列同源比对,并构建系统进化树。结果表明:金银花中筛选的 30 WRKY 基因的蛋白为 85~721 个氨基酸,理论等电点的范围为 4.85 9.76。所有 LjWRKY 基因编码的蛋白中只有 LjWRKY6 为稳定蛋白,其余均属于不稳定蛋白,所有蛋白均属于亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果,LjWRKY 所有蛋白定位于细胞核。除 LjWRKY23 不具有 Try 磷酸化位点,其它所有氨基酸均具有 SerThr Try 磷酸化位点。LjWRKY 蛋白比较保守,WRKYGQK 没有发生任何变异,且包含三类 WRKY 转录因子。系统进化树发现,有 12 WRKY 基因与已知抗寒基因有同源性,推测其参与了金银花低温逆境下的反应。研究结果可以通过筛选的 WRKY 基因,进行进一步的转基因验证,进而为植物抗寒分子育种提供分子基础。

关键词
金银花;WRKY;序列分析;系统发育
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• 第 17 卷
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