植物Bowman-Birk蛋白酶抑制剂家族的基因组学分析  

廖东颖 , 古袁扬 , 李超林 , 邓银 , 周嘉裕* , 廖海*
西南交通大学生命科学与工程学院, 成都, 610031
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2018年06月02日    接受日期: 2018年06月14日    发表日期: 2019年07月09日
© 2019 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要

本研究首先利用 HMMER 软件对从植物基因组网站 phytozome 上下载的 16 种植物的基因组进行检索,再利用 Pfam SMART 数据库进一步验证,最终获得 91 Bowman-Birk 基因。随后进行理化性质分析、系统发育分析、染色体定位及表达分析等。多序列比对结果表明 CCD Bowman-Birk 抑制剂中保守性最高,此外多个位点的 Cys 也具有一定程度的高保守性,表明二硫键在维持 Bowman-Birk 抑制剂的结构稳定性和抑制活性发挥了至关重要的作用。系统发育分析的结果显示 Bowman-Birk 基因分为单子叶植物和双子叶植物 2 个簇,表明 Bowman-Birk 基因家族的基本特征在单双子叶植物分离之前就已经形成。EST 表达分析结果表明 Bowman-Birk 在不同植物组织中的表达具有差异性,例如大豆的 Bowman-Birk 基因主要在豆荚中表达,其次是种子,而水稻主要在叶和根中表达。由于豆荚和叶等组织易受到昆虫侵食,因此在这些部位表达 Bowman-Birk 蛋白酶抑制剂基因有助于增强植物对昆虫的抗性。而种子和根等器官与植物生长发育密切相关,因此 Bowman-Birk 抑制剂在种子和根中的高表达可能与植物逆境胁迫响应相关。

关键词
植物; Bowman-Birk; 生物信息学分析
《分子植物育种》官方网站
• 第 17 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
廖东颖
.
古袁扬
.
李超林
.
邓银
.
周嘉裕*
.
廖海*
相关论文
.
植物
.
Bowman-Birk
.
生物信息学分析
服务
. 发表评论