研究报告

松萝凤梨转录组测序分析  

金亮* , 田丹青 , 詹书侠 , 安霞 , 葛亚英 , 王炜勇
浙江省农业科学院花卉研究开发中心, 国家花卉工程技术研究中心凤梨研发与推广中心, 杭州, 311202
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2018年07月02日    接受日期: 2018年07月12日    发表日期: 2019年07月09日
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摘 要

松萝凤梨(Tillandsia usneoides)是空气凤梨的一种,可以“生长在空气中”,主要通过叶片吸收水分和养分。为探讨松萝凤梨叶片功能的遗传基础,本研究采用高通量测序技术对其叶片进行转录组测序。总计获得了 62 779 条单基因簇(Unigene)。对所得 Unigenes 进行不同数据库注释,其中 34 419 Unigenes 在数据库中有注释,占总 Unigenes 数目的 54.82%。在 NrNt SwissProt 数据库中,分别有 7 条、10 条、13 Unigenes 与根相关;GO 数据库注释显示 25 695 Unigenes 分为细胞组分、分子功能及生物学过程等 3 大类 55 个功能组,其中与根相关 Unigenes 达到 48 条;KOG 数据库中注释到的 13 205 Unigenes 功能系统分为 26 类;KEGG 代谢通路分析表明,5 574 Unigenes 涉及 250 条通路,其中 34 Unigenes 涉及景天酸代谢(CAM)途径。本研究结果为松萝凤梨分子生物学方面研究提供了一定的基础及参考。

关键词
松萝凤梨;转录组; 测序; 基因分析; 功能注释
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• 第 17 卷
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