研究报告

金冕草盐胁迫转录组差异性分析  

屈兴红 , 曾洪学 *
浙江同济科技职业学院, 杭州, 311231
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2018年11月26日    接受日期: 2018年12月06日    发表日期: 2019年07月09日
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摘 要

为揭示金冕草在盐胁迫处理下基因表达谱的变化,在缺乏参考基因组的情况下采用高通量Illumina HiseqTM 4000 测序技术对金冕草进行转录组测序,并对测序数据进行分析,探究金冕草响应盐胁迫的适应机制。结果表明:盐胁迫 24 h 上调和下调的 DEGs (Differential-expressed genes)分别有 6 707 个和1 972 个;48 h 分别有 8 652 个和 1 747 个。在 GO 富集分析中,差异基因主要存在于细胞成分、生物进程、结合和催化活性中。KEGG 分析结果表明,差异基因主要参与核糖体、植物激素信号转导、氨基酸生物合成等代谢途径。通过 GO KEGG 显著性富集分析得知,NaCl 胁迫下差异表达上调的基因数明显多于下调的基因表达数。qRT-PCR 验证了 DEGs 的表达趋势与 RNA-Sep 测序分析结果一致,证明了 RNA-Sep 结果的准确性。本研究为金冕草耐盐分子机制研究提供了参考依据。

关键词
金冕草(Paspalum notatum);盐胁迫;高通量测序; 转录组
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• 第 17 卷
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