李婉琳 , 贺斌 , 肖继坪 , 郭华春

云南农业大学农学与生物技术学院, 昆明, 650201
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34 卷, 第 408 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

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近年来，马铃薯受根结线虫的危害日益严重，造成减产、植株萎蔫、影响其商品性，并使其很容易受其他土传病害侵染。而不同马铃薯材料对根结线虫抗病性存在明显差异。因此，从分子角度挖掘和利用其本身所具备的抗病基因变得尤为重要。本研究采用电子克隆技术，搜索马铃薯EST数据库，拼接获得28714条重叠群（contigs），以番茄、辣椒中已经克隆的根结线虫抗性基因作为探针，与所拼接的contigs进行比对及序列分析，共获得2条马铃薯根结线虫抗性基因的cDNA序列（Contig_5164，Contig_12247）。进一步采用生物信息学方法，对所得2条抗性基因序列进行了氨基酸组成和亲缘关系的分析。结果显示，Contig_5164总长1191bp，推测编码206个氨基酸，等电点为4.77。Contig_12247总长892bp，推测编码114个氨基酸，等电点为4.24。氨基酸组成均以亮氨酸最多，谷氨酸其次。两基因与番茄亲缘关系最近。随后对拼接所得contigs进行功能注释和GO分类，完成了对马铃薯中5类抗病保守结构域基因的挖掘。本文的研究结果可为马铃薯根结线虫抗性基因进一步的研究与应用以及开发利用马铃薯抗性资源奠定基础。

马铃薯；根结线虫；电子克隆；抗病基因