江苏科技大学生物技术学院, 镇江, 212018
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37 卷, 第 58 篇
收稿日期: 2017年01月05日 接受日期: 2017年01月10日 发表日期: 2018年02月25日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37 卷, 第 58 篇
收稿日期: 2017年01月05日 接受日期: 2017年01月10日 发表日期: 2018年02月25日
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摘要
利用生物信息学方法在桑树全基因组数据库中鉴定出 Trihelix 家族成员 29 个,序列聚类和功能结 构域分析发现该家族成员均含有高度保守的、特征性的 Trihelix 结构域;根据亲缘关系远近和结构域特点, 将其分为 5 个亚家族;基于 MEME 程序分析发现桑树 Trihelix 转录因子家族的保守基序与聚类分析具有较 高的一致性。研究初步明确了桑树 Trihelix 转录因子家族成员、结构和功能特点,为进一步揭示桑树 Trihelix 转录因子家族的系统发育和生物学功能提供了基础。
关键词
桑树;Trihelix;转录因子家族;进化
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