华北理工大学生命科学学院, 唐山, 063009
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37 卷, 第 52 篇
收稿日期: 2017年03月03日 接受日期: 2017年04月03日 发表日期: 2018年02月25日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37 卷, 第 52 篇
收稿日期: 2017年03月03日 接受日期: 2017年04月03日 发表日期: 2018年02月25日
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摘要
DREBs(dehydration responsive element binding)是植物中特有的一类转录因子,在干旱、低温、高盐等多种环境胁迫中发挥重要的作用。本研究在全基因组水平上对谷子中的DREB亚家族进行了生物信息学分析,在谷子基因组中共找到65个编码DREB的基因,分布在9条染色体上;根据其序列特点,分成6(A1-A6)个组;在基因结构和蛋白模体组成上,每组存在着各自的特点;串联重复和片段重复对谷子DREB亚家族的扩增发挥了重要作用;谷子进化过程中DREB基因受到了强烈的正选择,加速了该类基因的进化。这些结果将为深入研究谷子DREB基因的功能奠定基础,同时也为揭示谷子的抗逆机制提供一定的线索。
关键词
谷子;DREB;基因家族;全基因组;系统进化
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