本研究对浙江省枸杞岛贻贝养殖区大型海藻资源进行了调查，在形态学观察的基础上，选取 93 株 红藻样品运用 DNA 分子条形码技术进行分子鉴定分析。采用的 3 个分子标记分别为 rbcL (叶绿体基因组中 1,5- 二磷酸核酮糖羧化 / 加氧酶大亚基基因)，COI (细胞色 C 氧化酶亚基 I)和 UPA (23S rRNA 基因片段, 通 用质体扩增区)基因片段。通过实验，我们共扩增出 rbcL 基因片段 79 条，扩增成功率为 84.95%；共扩增出 COI 基因片段 63 条，扩增成功率为 67.74%；共扩增出 UPA 基因片段 76 条，扩增成功率为 81.72%。3 个分子 标记的测序成功率分别为：rbcL 基因 78.49%，COI 基因 29.03%，UPA 基因 72.04%。COI 基因的扩增效率和测 序成功率均低于 rbcL 和 UPA 基因。基于 3 个基因构建(Neighbor-joining, N-J)系统进化树表明，rbcL 基因 可以将红藻样品归类为 5 目，6 科，7 属，12 种；COI 基因可以将样品归类为 4 目，5 科，5 属，5 种；UPA 基因可 以将样品归类为 6 目，7 科，8 属，11 种。rbcL、COI 和 UPA 3 个基因结合可以将样品归类为 7 目 8 科 11 属 21 种。 研究表明 rbcL 基因以及 UPA 基因较适合做为鉴定大型红藻的分子标记，COI 基因做为红藻分子标记的潜 力有待进一步开发和研究。