王维东¹ , 赵德刚^1,3* , 赵懿琛^1,2*

1 贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院, 山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室, 贵阳, 550025; 2 贵州大学药学院,贵阳, 550025; 3 贵州省农业科学院, 贵阳, 550006
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基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37 卷, 第 54 篇   
收稿日期: 2017年03月31日    接受日期: 2017年04月24日    发表日期: 2018年03月25日

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分别以杜仲基因组 DNA 和 cDNA 为模板克隆 DIRs 基因，并分析其序列及其蛋白的遗传特性。以 杜仲为研究对象，利用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)技术获得杜仲 DIRs 序列，并结合生 物信息学方法对杜仲 DIRs 的序列进行深入分析。从杜仲中克隆 DIRs 基因序列，利用生物信息手段分析 DIRs 基因与其它物种的同源性、结构域、功能域、蛋白质理化特性、蛋白质序列跨膜区、亚细胞定位、磷酸化 位点、糖基化位点以及编码蛋白二级结构等进行分析。克隆的杜仲 DIRs 片段序列有 468 bp，不含内含子，编 码 155 个氨基酸。推测的编码蛋白的氨基酸序列与芝麻、五味子同源性最高，分别达 71%和 70%，具有的 5 个保 守基序，第 1~148 位之间是个高度保守的结构功能域—Dirigent，为亲水性蛋白，相对分子质量为 17 kD，理 论等电点为 4.91，不具有跨膜区；亚细胞定位在细胞质中，不属于分泌蛋白；序列预测具有 13 个磷酸化位点， 未预测到糖基化位点，二级结构主要以无规则卷曲结构组成。以上研究为进一步探讨 DIRs 基因在木脂素生 物合成途径中的功能提供了理论依据。

杜仲； 基因克隆；序列分析