文娅^1,2 , 张满桥^1,2 , 陆菁潇² , 刘文² , 孙小娟^2*

1 广州医科大学研究生院, 广州, 511436; 2 深圳大学第一附属医院深圳市第二人民医院, 深圳市肿瘤免疫基因治疗及临床应用工程实验室, 生物样本库, 深圳, 518035
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基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2017年02月03日    接受日期: 2017年05月03日    发表日期: 2018年03月25日

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为了获得 琢-LA 作用肺癌细胞后的转录组数据库和差异表达基因，我们将 A549 细胞处理组和对照组作为测试样品，采用 Illumina HiSeqTM2000 测序技术进行转录组测序，并进行系统的生物信息学分析。对照组和处理组两两比较共获得 6 748 个差异表达基因。GO (gene ontology)分类分析表明，差异表达基因属于细胞组分、分子功能和生物学过程的 46 个类别。KEGG Pathway 显著性富集分析提示差异表达基因共涉及 15 条途径，包括肿瘤相关通路、内质网蛋白加工、细胞周期、核糖体、剪接体等相关途径。对 α-LA 作用肺癌细胞的转录组进行拼接、组装和功能注释，得到大量转录本信息，为探究 α-LA 作用肺癌细胞后基因差异表达及相关分子机制提供了宝贵的基因组数据库资源。

α- 硫辛酸；肺癌细胞；转录组；差异基因表达