王新新^1,2 , 吴亮¹ , 朱生凤³ , 李广茹¹ , 赵林² , 吕妍¹ , 李飞雪¹ , 陈宇¹

1中海石油环保服务有限公司, 天津, 300452;
2天津大学环境科学与工程学院, 天津, 300072;
3中国海洋石油总公司, 北京, 100010
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 62 篇   
收稿日期: 2012年04月16日    接受日期: 2012年06月05日

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为了获取茎瘤固氮根瘤菌(Azorhizobium caulinodans ORS571)的分泌蛋白，以便更深入地了解该菌的共生固氮作用，本研究采用SignalP、TMHMM、PSORTb、TargetP、LipoP、TatP和SecretomeP软件对该菌全部4 717个蛋白序列进行分析预测。结果共识别了653个分泌蛋白，其中具有分泌型信号肽的蛋白54个，具有RR-motif型信号肽的蛋白1个，具有脂蛋白信号肽的蛋白2个和非经典分泌蛋白596个。该菌含信号肽分泌蛋白仅占全部蛋白的1.2%，低于其它固氮菌。在分泌蛋白中识别了核酸内切酶和核糖核酸酶等6个核酸酶。它们可能参与宿主植物遗传物质的降解，干扰宿主遗传代谢，进一步在宿主植物侵染过程中起到重要作用。此外还识别了超氧化物歧化酶、过氧化氢酶和谷胱甘肽S-转移酶等4个抗氧化酶。它们可能参与活性氧的清除以保护固氮酶，是该菌固氮过程的重要参与者。

茎瘤固氮根瘤菌；ORS571；基因组；分泌蛋白；核酸酶；抗氧化酶