不同牛种CSN1S1 基因启动子区SNP 研究 
杨永强 
,
龚俞 ,
焦仁刚 ,
惠嫣婷 ,
刘若余 
,
龚俞 ,
焦仁刚 ,
惠嫣婷 ,
刘若余
1贵州大学动物科学学院, 高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室, 贵阳, 550025;
2贵州省畜牧技术推广站, 贵阳, 550001
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 92 篇
收稿日期: 2012年09月09日 接受日期: 2012年10月18日
2贵州省畜牧技术推广站, 贵阳, 550001
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 92 篇
收稿日期: 2012年09月09日 接受日期: 2012年10月18日
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摘 要
为研究牛CSN1S1 基因启动子多态性，选择产奶性能差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA 池，设计1 对引物分别扩增2 个牛种CSN1S1 基因5' 调控区及第1 外显子部分序列总长1 035 bp。结果表明：CSN1S1 基因5' 调控区存在3 个新SNPs 位点：G531A、C-706T、T-761C，2 个牛品种在各位点表现出不同多态性特征。生物信息学软件预测CSN1S1 基因核心启动子区及转录因子结合位点，SNP 位点造成核心启动子区2 个重要转录因子结合位点消失，而产生3 个新的转录因子结合位点。突变前后RNA 二级结构有明显改变，目标序列未发现CpG 岛。研究结果为进一步确定CSN1S1启动子功能奠定实验基础。
关键词
CSN1S1；SNP；启动子；贵州荷斯坦奶牛；务川黑牛
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