组合调控中过表达模体对距离的统计检验  

陈丹1 , 梁振霞1 , 李慧敏2
1 云南大学数学与统计学院,云南 昆明 650091;
2 云南民族大学数学与计算机科学学院, 云南 昆明, 650031
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2012年09月10日    接受日期: 2012年10月08日
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摘 要

揭示真核生物转录调控机制是生物信息学的一项重要研究内容。转录调控的一个重要特征是基因受多个转录因子的组合调控.在用系统生物学和数学建模的方法识别组合调控中的转录因子结合位点时,过表达模体对的距离检验是其关键步骤之一。本文对组合调控模体对距离检验的三种方法进行了综述,同时给出了三种检验的数学模型和具体检验方法。文章为研究基因的组合调控和探测潜在的过表达模体对提供理论支持。

关键词
曼-惠特尼U检验;两样本的Kolmogorov-Smimov test检验;单样本的Kolmogorov-Smimov test检验;数学模型; 模体对的距离
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基因组学与应用生物学
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