李成慧¹ , 蔡斌² , 梁英海² , 贾士禄¹

1 苏州农业职业技术学院, 苏州, 215008; 2 南京农业大学园艺学院, 南京 210095
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2012年12月01日    接受日期: 2012年12月05日

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孤儿基因为某物种基因组内特有的，在其它物种内没有同源基因存在的特殊基因。对物种孤儿基因的鉴定和分析已成为比较基因组学研究的一个新兴领域。本研究通过生物信息学的分析，着重研究了49个葡萄孤儿基因在各发育阶段和各器官中的特异表达特性、亚细胞定位预测和共表达基因群的生物学过程基因本体论(GO)分析。结果显示，35个基因在NCBI的EST数据库中存在EST表达证据，其中有7个基因具有器官表达特异性，且大部分在生殖器官中特异表达。通过亚细胞定位预测到大部分葡萄孤儿基因为分泌蛋白。GO分析表明葡萄孤儿基因的共表达基因群主要参与寡肽转运和跨膜运输等生物学过程，这与葡萄孤儿基因的亚细胞定位预测结果相一致。本文研究结果将为葡萄孤儿基因的进一步功能分析提供重要研究基础。

孤儿基因；葡萄；生物信息学