玲玲 , 磊 , 德刚 , 懿琛

作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37卷, 第 0 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

本研究根据实验室前期构建的杜仲基因组数据库注释的信息设计特异性引物, 利用同源克隆的方法从杜仲转录本中克隆得到一个基因的全长编码序列(CDS), 将该基因命名为EuDREB1。序列分析结果显示该基因的编码序列全长为255bp, 共编码84个氨基酸, 含有一个保守的AP2结构域, 且该结构域的第14位氨基酸为缬氨酸(V), 符合EREBP转录因子中DREB类转录因子的蛋白序列特征, 推断EuDREB1基因属于该类转录因子基因。分析可知, 转录因子EuDREB1为不稳定的亲水性蛋白, 相对分子质量为9.41kD, 理论等电点pI为5.66, 无信号肽及跨膜结构存在但含有多个磷酸化位点; 其二级结构中含有4个ɑ-螺旋、1个β-折叠及6个无规卷曲; 其三级结构以ɑ螺旋及β折叠为主, 符合AP2结构域的模型特征。本研究通过克隆EuDREB1基因并进行相应的生物信息学分析, 为进一步探明杜仲EREBP转录因子相关基因的功能提供了一定的实验基础。