张亚东 , 赵慧茹 , 周倩 , 高必达

作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 46 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

本文运用RT-PCR方法克隆了黄瓜绿斑驳花叶病毒（Cucumber green mottle mosaic virus，CGMMC）湖南邵阳株系的基因组MP（CGMMV-HuNSY Movement Protein）片段，测序并进行了分析。结果显示，片段全长共有803bp (KC684977)，编码由264个氨基酸组成的蛋白质，推测分子量约28.87kDa，理论等电点pI为9.06，ProtParam预测显示为不稳定蛋白，与已报道的辽宁分离物病毒的MP作比较，核苷酸相似性为99.6%，氨基酸相似性为98.9%；湖南邵阳株系CGMMV MP蛋白无高度卷曲螺旋部位，有跨膜结构区域，该部位表现为疏水性，可能为蛋白互作位点；磷酸化位点均匀分布于整个多肽链中，存在5个主要的B细胞抗原表位预测位点；对烟草花叶病毒属病毒MP氨基酸序列进行了motif查找，发现了该属病毒氨基酸序列的3个保守区段，还进行了密码子偏向性分析。此外，发现了1个酰胺化位点和1个依赖于cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点，可能与病毒的侵染机制有关。

黄瓜绿斑驳花叶病毒；RT-PCR；测序；生物信息学分析