牛大力块根cDNA文库的构建及EST分析  

徐立1 , 郝宏刚2 , 李志英1 ,
1 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/ 农业部热带作物种质资源利用重点开放实验室/ 海南省热带作物种质资源遗传改良与创新重点实验室, 儋州, 571737
2 海南大学, 海口, 571700
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 57 篇   
收稿日期: 2013年03月21日    接受日期: 2013年04月02日
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摘 要

采用SMART技术构建了牛大力块根cDNA文库,并对其进行了质量检测。结果表明,原始文库滴度达6.17×107 pfu/mL,重组率达90.9%,平均插入片段大小约为1.3 kb。利用该文库随机挑选了1728个克隆进行测序,共获得1571个有效的ESTs (Expressed Sequence Tags表达序列标签),序列的平均长度为641 bp。用CodonCode Aligner软件聚类拼接,得到1009个独立基因,其中169个独立基因具有分子功能注释,其余均为未知功能基因。169个具有分子功能注释的独立基因中,与蛋白结合活性和催化活性相关的基因分别达到了40%和33.5%;在药用代谢方面和参与根生长相关方面分别获得5个和9个独立基因,这些基因的发现为进一步改良牛大力品质、研究牛大力根系的生长发育奠定了分子基础。

关键词
牛大力; cDNA 基因文库; EST
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基因组学与应用生物学
• 第 32 卷
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