陈炳智 , 谢宝贵 , 胡良韬 , 邓优锦 , 江玉姬 , 刘新锐 , 贵甫

福建农林大学菌物研究中心，福州，350028
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 87 篇   
收稿日期: 2013年05月08日    接受日期: 2013年05月17日

本文基于本实验室的草菇Volvariella volvacea基因组测序，分析了草菇基因组中的tRNA情况。草菇基因组的302个框架中，共发现了177个tRNA基因，其中有7个可能的假基因，有2个携带硒代半胱氨酸，一个抑制性tRNA基因和一个未知的异型结构tRNA。除了上述11个特殊的tRNA基因外，166个tRNA可按反密码子类型分成47类。与其它5种担子菌的基因组tRNA比较，草菇的tRNA数量处于第4位，少于鬼伞、裂褶菌、灵芝，多于双孢蘑菇和平菇。通过比较分析草菇及这5种大型真菌的基因组tRNA编码情况，首次报道了几种食用菌遵tRNA遵守修正的摆动假说的情况。另外，草菇的同功受体tRNA非编码子序列也具有差异性，对tRNA的分析将有助于进一步研究草菇的进化。

草菇基因组；tRNA基因；修正的摆动假设；同功受体tRNA