高糖土壤微生物宏基因组文库的构建及β-葡萄糖苷酶基因鉴定  

陆坚1 , 杜丽琴1 , 庞浩2 , 马贵1 , 韦宇拓1 , 黄日波2
1 广西大学生命科学与技术学院,广西亚热带生物资源保护利用重点实验室, 南宁, 530005
2 广西科学院国家非粮生物质能源工程技术研究中心, 南宁, 530004
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 22 篇   
收稿日期: 2012年12月13日    接受日期: 2013年01月09日
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摘 要

采用宏基因组技术构建了高糖土壤微生物的DNA文库,该文库约含9万个克隆,文库外源DNA总容量为3.1×109 bp。利用活性筛选策略,对文库进行筛选,获得11个β-葡萄糖苷酶的阳性克隆,并对其中2个表达β-葡萄糖苷酶的克隆进行亚克隆和序列分析,获得两个编码新型β-葡萄糖苷酶的基因分别命名为:unbgl3Aunbgl3B。生物信息学分析表明:unbgl3A基因由2241个碱基对组成,unbgl3B基因由2292个碱基对组成。在核苷酸水平上,unbgl3A、unbgl3B与已知数据库中的β-葡萄糖苷酶基因没有任何相似性。在氨基酸水平上,与GenBank数据库中已知β-葡萄糖苷酶的相似性分别为73%和69% 。

关键词
糖土壤;未培养微生物;宏基因组文库;β-葡萄糖苷酶
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基因组学与应用生物学
• 第 32 卷
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