王梦楠¹ , 吴茜红¹ , 赵姝君¹ , 王敬姣¹ , 李冬杰² , 李世杰¹

1 河北农业大学 生命科学学院,保定, 071001
2 河北科技大学 生物科学与工程学院, 石家庄, 050018
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 93 篇   
收稿日期: 2013年07月19日    接受日期: 2013年08月09日

在人与小鼠中，ASCL2基因是一个母源表达的印记基因，编码螺旋-环-螺旋结构转录因子。ASCL2基因在早期胚胎和胎盘发育中起重要作用。在牛中，ASCL2基因的印记状态和印记的分子机理还没有被研究。本研究采用生物信息学方法对牛ASCL2 基因分子进化、启动子和CpG岛区域以及蛋白的高级结构进行分析和预测，为进一步揭示该基因生物学功能和其分子调控机理奠定基础。对21种哺乳动物ASCL2 基因的mRNA序列进化分析表明：这21种哺乳动物间的遗传距离小于0.536，且牛与猪遗传距离最小，为0.106，与基因进化树分析结果一致。CpG岛在线软件预测显示，在牛中该基因上游5k序列中有3个CpG岛。启动子在线软件预测和转录因子分析相结合显示，启动子最可能位于该基因5′端上游4725～4775 bp处CpG岛区域内，此区域包括大量潜在转录因子结合位点，并在4734 bp处存在一个TATA框。蛋白质在线软件分析表明，ASCL2 基因编码一种螺旋-环-螺旋形转录因子，有α-螺旋、β-转角和无规则卷曲3种二级结构。

牛；ASCL2基因；生物信息学；启动子；CpG岛