广西德保猪MC1R基因的克隆与分析  

杨厚德1 , 林宇纾2 , 廖玲玲1 , 刘庆友2 , 石德顺2 , 谢炳坤1 , 崔奎青2
1 广西壮族自治区畜牧研究所广西家畜遗传改良重点实验室,南宁 2 广西大学亚热带生物资源保护利用国家重点实验室, 南宁,530005
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2013年07月10日    接受日期: 2013年08月29日
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摘 要

为探讨广西地方品种德保猪毛色形成的分子机制, 本文克隆了广西德保猪MC1R基因并进行了系统生物信息学分析。根据NCBI已公布的猪MC1R基因序列(GI:347618788)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的基因组DNA为模板,通过PCR扩增克隆获得长1519 bp的MC1R基因序列片段。多重序列比较结果显示克隆片段与已公布的猪、牛、人、狗、绵羊、小鼠和鸡的相似性依次分别为99%、87%、86%、85%、84%、81%和77%,表明MC1R基因在不同哺乳动物间具有较高的保守型。德保猪MC1R蛋白结构预测结果显示,其理论分子质量为34.65ku,等电点为8.70,为弱碱性蛋白,N-末端不存在信号肽,定位于细胞质膜,具有1个低复杂度结构域和7个跨膜结构域,包含15个α-螺旋,13个β-折叠,4个T-转角以及10个无规则卷曲。本研究为阐明广西地方品种德保猪毛色形成的分子机制奠定了较好的实验基础。

关键词
德保猪;黑素皮质激素1受体;毛色
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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