硬叶兜兰SRAP-PCR体系建立及亲缘关系研究  

李宗艳1 , 李静1 , 郭荣2 , 秦艳玲1
1 西南林业大学园林学院,昆明,650224
2 西南林业大学基础部,昆明,650224
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2013年08月06日    接受日期: 2013年09月11日
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摘 要

摘要:采用CTAB法对硬叶兜兰叶片总DNA进行提取,通过正交实验设计,用SRAP正向引物me1(5'-TGAGTCCAAACCGGATA-3')和反向引物em2 (5'-ACACACACACACACACT-3')对反应体系进行优化;并应用其进行种群遗传差异分析。结果表明:优化的20µl的PCR反应体系中DNA模板为90ng,Taq DNA聚合酶1.6 U, dNTPs 0.30 mmol·L-1,Mgcl2 2.0mmol/L 和引物各0.50 µmol·L-1,经重复电泳和银染,验证适合进行硬叶兜兰的SRAP分析;利用该体系对7个不同种源的167份硬叶兜兰进行SRAP-PCR扩增,对筛选的10个引物扩增,共得到288条条带,其中多样性条带234条,多态位点百分率(PPB)为81.25%;种群的遗传距离值在0.0659-0.1916,UPGMA聚类结果显示供试种群在遗传相似度为0.863时,可以分为2支,即第一分支由马固、斗咀和杨柳井居群组成,第二支由古林箐、夹寒箐、小坝子和田坝居群组成。SRAP标记可用较好地适用于硬叶兜兰种群遗传差异的鉴定。

关键词
硬叶兜兰;SRAP-PCR反应体系;遗传变异;亲缘关系
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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