广西壮族自治区水产研究所, 广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室, 南宁, 530021
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 62 篇
收稿日期: 1970年01月01日 接受日期: 1970年01月01日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 62 篇
收稿日期: 1970年01月01日 接受日期: 1970年01月01日
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摘 要
凡纳滨对虾是世界养殖最广泛的甲壳动物,但是目前凡纳滨对虾的基因组及转录组数据还比较缺
乏。为了获得凡纳滨对虾的转录组信息,本研究应用454 高通量测序技术对凡纳滨对虾肝胰腺的转录组进
行测序。获得了500 177 条凡纳滨对虾EST,平均长度363 bp。拼接获得了20 225 条unigene,长度范围50~
8 980 bp,平均长度507 bp。所有unigene 与NCBI 的非冗余蛋白质数据库(Nr)进行相似搜索(E 值<10-5),结果
一共有13 676 条unigene (68%)与数据库中的已知基因同源。此外,还对unigene 进行了GO、COG 和KEGG
的功能注释、分类或通路分析。我们通过高通量测序,获得了丰富的凡纳滨对虾转录组信息,为凡纳滨对虾
的新基因克隆和基因组学研究提供了有价值的数据。
关键词
高通量测序;凡纳滨对虾;转录组
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