药用资源与天然药物化学教育部重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西师范大学生命科学学院, 西安, 710062
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 41 篇
收稿日期: 2013年10月08日 接受日期: 2013年11月29日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 41 篇
收稿日期: 2013年10月08日 接受日期: 2013年11月29日
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摘 要
对丹参EST序列进行Blast分析,得到一条海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)基因,将其命名为SmTPS,GenBank注册号为JF937196。该基因cDNA全长2836 bp,包含一个长为2574 bp的ORF,编码857个氨基酸。生物信息学分析表明,分子量为97.04 kDa,等电点为5.76,含α-螺旋,β转角,延伸连和无规则卷曲。该蛋白同时具有海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)和海藻糖-6-磷酸磷酸酯酶(TPP)的功能结构域。系统进化树分析表明丹参TPS功能域和拟南芥AtTPS6属于一类,而TPP功能域与低等生物酵母ScTPS2属于一类。实时定量PCR结果分析表明,SmTPS基因在丹参不同组织器官中差异表达,其茎中表达量最高。在干旱处理下,其表达量与对照相比可上调约2倍,表明SmTPS基因在丹参抵抗干旱胁迫中发挥一定的作用。
关键词
丹参; 海藻糖; 基因克隆; 表达分析
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