庞纪彩^1,2 , 高风英¹ , 卢迈新¹ , 赵金良² , 朱华平¹ , 可小丽¹ , 刘志刚¹

1 中国水产科学研究院珠江水产研究所, 广州, 510380; 2 上海海洋大学水产与生命学院, 上海, 201306
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基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 43 篇   
收稿日期: 2013年11月04日    接受日期: 2013年12月24日

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利用一对特异性引物MHC 2b snp sf 和MHC 2b snp sr，从广东省3个不同的罗非鱼养殖地区（以下分别称高要群体、茂名群体、惠州群体）采集尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus，GIFT strain）共137尾个体基因组中扩增出长度为775-796 bp的片段。克隆后测序，序列分析结果显示：775-796 bp的核苷酸序列中共检测出62个简约信息位点，49个单碱基突变位点。112个多态位点中，增添/缺失位点34个，转换位点44个，颠换位点33个。137尾个体的751个阳性克隆的测序结果分析表明，751条序列分属于4个等位基因。其中，等位基因Orni-DAB*0101在3个群体中所占比例最高（85.2%）。等位基因的分布及群体内遗传多样性参数分析表明：高要、茂名群体多样性较丰富，惠州群体多样性较低。群体间的分化指数（F_ST值）、平均基因流（Nm）、分子方差分析（AMOVA）和平均K 2-P遗传距离均表明3个养殖群体间存在广泛的基因交流，未发生群体间的遗传分化。该研究结果提供了广东地区养殖尼罗罗非鱼MHC IIB基因的部分遗传信息，为尼罗罗非鱼抗病品系的选育提供理论依据。

尼罗罗非鱼；主要组织相容性复合体(MHC)； 多态性； 遗传分化