1 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁,530004;2 广西大学生命科学与技术学院,南宁,530004;3广西大学动物科学与技术学院,南宁,530004
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 38 篇
收稿日期: 2013年12月09日 接受日期: 2014年02月04日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 38 篇
收稿日期: 2013年12月09日 接受日期: 2014年02月04日
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摘 要
本文旨在分析Xcc 8004菌株分泌蛋白的蛋白表达谱,建立Xcc 8004分泌谱分析方法。首先将诱导的Xcc 8004分泌蛋白进行液体酶解,通过HPLC阳离子交换柱分离多肽,采用EASY-nLC结合Orbitrap质谱鉴定分泌谱。经过过滤筛选后,共精确鉴定蛋白1532个,SignalP分析其中包含286个含信号肽且不含跨膜区,其中118个为假定蛋白。对286个可能的分泌蛋白进行基因本体评注分析,其中,主要为行驶水解酶类,受体蛋白,信号传导等重要的微生物-植物互作介导蛋白。本研究通过液相色谱-质谱联用能够高效鉴定Xcc 8004的分泌蛋白,对这些鉴定的分泌蛋白的信息学分析有利于我们进一步研究Xcc 8004的致病机制,为研究微生物植物相互作用鉴定了方法与理论基础。
关键词
Xcc;分泌蛋白;Orbitrap;Gene Ontology
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