马氏珠母贝IKKε同源基因的克隆及表达分析  

焦钰 , 杜晓东 , 王庆恒 , 黄荣莲 , 邓岳文
广东海洋大学水产学院, 湛江, 524025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 55 篇   
收稿日期: 2013年12月17日    接受日期: 2014年01月28日
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摘 要

IKKε(Inhibitor of NF-κB kinases ε)是NF-κB(Nucleur Factor κB)信号通路中的关键成员,参与调控细胞的分化、发育、凋亡及免疫反应。本研究应用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得了马氏珠母贝IKKε基因cDNA的全长序列(PmIKKε)并对其序列特征进行分析;同时利用荧光定量PCR(Real-time PCR)技术检测了马氏珠母贝七个组织中PmIKKε基因mRNA的表达。结果表明:PmIKKε基因cDNA全长2843 bp,其中5'UTR为116 bp,3'UTR为516 bp,含有27 bp polyA,开放阅读框为2211 bp,编码737个氨基酸残基。多序列比对显示PmIKKε与其它物种IKKε有较高的保守性,与牡蛎的序列相似性有45%。软件分析结果显示PmIKKε的N端含有一个蛋白激酶功能结构域和一个MAPKK(mitogen-activated protein kinase kinase)的激活位点,C端含有一个亮氨酸拉链(leucin zipper,LZ)和一个螺旋-环-螺旋结构(Helix-Loop-Helix, HLH)。荧光定量PCR分析表明PmIKKε在马氏珠母贝肝胰脏、性腺、血淋巴、鳃、外套膜、闭壳肌、足七个组织中均有表达,肝胰脏中表达量最高。本研究为进一步阐述PmIKKε在马氏珠母贝生长、发育及先天性免疫中的作用提供理论基础。

关键词
IKKε; Pinctada martensii; 基因克隆; 荧光定量PCR
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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