番木瓜酸性转化酶基因家族及其蛋白质3D结构预测分析  

严丹凤1 , 吴晓慧1 , 耿梦婷1 , 范洁1 , 姚远2 , 李瑞梅2 , 郭建春2
1 海南大学农学院, 海口, 570228; 2 中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海口, 571101
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 37 篇   
收稿日期: 2014年03月11日    接受日期: 2014年04月09日
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摘 要

酸性转化酶参与了番木瓜果实中蔗糖的韧皮部卸载,调控果实中糖类的积累。本文利用番木瓜基因组数据库信息,发现了番木瓜基因组中含有6个酸性转化酶,细胞壁转化酶和液泡转化酶各3个。蛋白质3D结构预测分析表明,细胞壁转化酶CpCWINV1、液泡转化酶CpVINV1和CpVINV2具有典型的N端β-螺旋桨模块(β-propeller module)和 C端β-三明治模块(β-sandwich module),而细胞壁转化酶CpCWINV3和液泡转化酶CpVINV3的桨叶I上,均没有保守区NDPNG/A;细胞壁转化酶CpCWINV2和液泡转化酶CpVINV3均缺失了β-三明治模块。本研究有助于我们进一步揭示酸性转化酶在番木瓜果实发育及糖类积累过程中的作用。

关键词
番木瓜; 酸性转化酶; 生物信息学分析
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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