野生型工业酿酒酵母Miseq测序方法的建立  

曹德民1 , 张穗生2 , 罗贞贞1 , 黄日波1,2
1 广西大学生命科学与技术学院,南宁,530003
2 广西科学院广西生物炼制重点实验室、非粮生物质酶解国家重点实验室、国家非粮生物质能源工程技术研究中心,南宁,530007
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 91 篇   
收稿日期: 2014年02月18日    接受日期: 2014年02月26日
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摘 要

新一代测序方法在基因组学研究应用日趋广泛,已经成为工业酿酒酵母菌株基因组学研究的重要技术平台,但对工业酿酒酵母新一代测序技术方法缺乏详细报道。Miseq是小型新一代基因组测序仪,本文报道我们自建的野生型工业酿酒酵母基因组Miseq测序方法。该方法包括:制备分离a型和α型交配型的单倍体菌株、采用电泳和分光光度法方法监控基因组文库建立、优化上机文库浓度后测序。其中电泳和分光光度法方法为首创的文库质量监控简易方法,质控检测得到酿酒酵母工业菌株测序条件为:菌株的基因组文库DNA片段大小为250~850bp且主要集中在350~550bp,文库浓度范围为7~13ng/μL;上机测序文库的优化浓度为20 pM。

关键词
酿酒酵母;野生型工业菌株;Miseq;基因组测序方法;文库质量
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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