尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种中GAS1基因的克隆与序列分析  

陈平亚1,2 , 毛超1,2 , 杨腊英2 , 黄俊生2
1 海南大学,海口,570228
2 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所;农业部热带农林有害生物入侵监测与控制重点实验室;海南省热带农业有害生物检测与控制重点实验室,海口,571101
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 126 篇   
收稿日期: 2014年04月28日    接受日期: 2014年05月23日
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摘 要

采用PCR和RT-PCR的方法,从尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种中克隆得到了FoGAS1基因的DNA及cDNA序列,并运用生物信息学的方法对该基因所编码的氨基酸序列进行分析,预测其编码蛋白质的结构和功能。结果表明,FoGAS1基因全长1672bp,其中开放阅读框全长1623bp,编码含有540个氨基酸残基的蛋白质,该蛋白分子量为58398.1,等电点pI=4.83,为性质稳定的亲水性蛋白。FoGAS1蛋白为跨膜蛋白,含有22个丝氨酸磷酸化位点,2个苏氨酸磷酸化位点,8个酪氨酸磷酸化位点。该蛋白在C端有一个信号肽结构,为一种分泌蛋白。通过系统进化树分析,该蛋白在不同种属镰刀菌中高度保守。
 

关键词
FOC4 ;GAS1 ;生物信息学分析
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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