高源隆^1,2 , 董旋^1,3 , 赵德刚^1,2,3

1 贵州大学生命科学学院山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室,贵阳,550025
2 贵州大学农业生物工程研究院贵州省农业生物工程重点实验室,贵阳,550025
3 贵州大学绿色农药与农业生物工程国家重点实验室培育基地,贵阳,550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 119 篇   
收稿日期: 2014年04月09日    接受日期: 2014年05月14日

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以杜仲(Eucommia ulmoides Olive) 4月份雄花花芽cDNA为模板，依靠实验室构建的杜仲转录组库，采用cDNA末端快速扩增法克隆了3’端包含完整开放阅读框的745 bp cDNA序列，经3’RACE产物和转录组库中5’端序列拼接，获得全长为872 bp的杜仲FLC的cDNA序列，编码86个氨基酸，命名为EuFLC1。生物信息学分析显示：EuFLC1蛋白分子量约为10.005 kDa，理论等电点为10.47，为疏水性蛋白；存在3个可能的磷酸化位点、1个可能的核定位信号和1个可能的核输出信号；不存在跨膜螺旋和信号肽；蛋白二级结构中包含2个α螺旋和4个β折叠，无规卷曲连接α螺旋及β折叠；蛋白三级结构同源建模结果表明，EuFLC1蛋白包含2个互相垂直的α螺旋，α螺旋间有2个处于同一平面的β折叠，蛋白的N端和C端为无规卷曲并伸向整体结构的一侧；是含有MEF2_like型的MADS-box结构域的MADS-Box基因。Blastp结果中，与EuFLC1同源性最高的序列有：葡萄的flowering locus C、小粒种咖啡的MADS-box protein FLC subfamily、巨峰葡萄的 flowering locus C-like MADS-box protein，因此认为EuFLC1是杜仲FLC基因。系统发育树表明杜仲与同属唇形类植物的小粒咖啡聚为一支，与按APG III分类系统的分类结果一致。该基因为首次从第三纪孑遗植物杜仲中克隆到的MADS-Box基因。

杜仲；EuFLC1；克隆；生物信息学分析