滕飞翔 , 俞黎黎 , 卞勇华 , 孙金霞 , 张承伯 , 王楠 , 杨李 , 崔玉宝

盐城卫生职业技术学院医学检验学院,盐城,224005
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基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 123 篇   
收稿日期: 2014年04月16日    接受日期: 2014年05月22日

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使用ProtParam、PROSITE、Jpred、Modeller 9.12和 ABCpred等生物信息学工具来预测、比较分析尘螨变应原Der f 6、Der p 6和Blo t 6的理化性质、一级结构、二级结构、三级结构及抗原表位。Der f 6、Der p 6和Blo t 6氨基酸序列一致性为78.35%，都含有3个胰蛋白酶活性位点氨基酸及2个功能结构区特异性序列；二级和三级结构中都由α-螺旋、β-折叠和无规卷曲组成；活性位点氨基酸在三级结构中完全重合，并相互靠近构成蛋白酶的活性中心；主要潜在抗原表位区域为4-5个，并在第37-38aa和175-179aa区域出现了重合，但表位重合区的氨基酸种类不完全相同。本研究应用生物信息方法预测和比较了Der f 6、Der p 6和Blo t 6结构与抗原方面的信息，为进一步研究变应原功能、疫苗研制奠定了基础。

尘螨；变应原；结构；抗原表位