张武¹ , 马金田¹ , 潘伟¹ , 雷腾英²

1大理学院农学与生物科学学院, 大理, 671003
2大理学院艺术学院, 大理, 671003
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 142 篇   
收稿日期: 2014年06月20日    接受日期: 2014年08月06日

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利用菜豆根瘤菌Rhizobium etli CFN42全基因组测序结果，结合计算机技术和生物信息学分析方法，对菜豆根瘤菌蛋白质组中的分泌蛋白进行预测和分析，以便更深入地了解共生固氮的分子机制。经过分析发现，在该根瘤菌5 963个蛋白质中，具有信号肽的分泌蛋白332个，占总数的5.4%，主要涉及底物转运、物质代谢和信号转导等方面。在有功能描述的186个分泌蛋白中，识别了Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型分泌系统和丝氨酸蛋白酶，这些蛋白质可能参与了根瘤菌对宿主植物的侵染，是两者分子对话的关键参与者；在假定蛋白中，通过结构域分析，发现了SH3b、BA14K和EFh结构域，含有这些结构域的分泌蛋白可能参与了根瘤信号转导途径。在根瘤菌共生结瘤过程中，分泌蛋白发挥了重要作用。

菜豆根瘤菌；全基因组；分泌蛋白；信号肽